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| Catégorie de document |
Article ou chapitre dans un livre |
| Titre |
Interaction−Based Modeling of Morphogenesis in MGS |
| Auteur principal |
Jean-Louis Giavitto |
| Co-auteurs |
Olivier Michel, Antoine Spicher |
| Paru dans |
Morphogenetic Engineering, 2013, Springer |
| Collation |
p.409-440 |
| Année |
2013 |
| Statut éditorial |
Publié |
| Résumé |
In this chapter, we advocate a domain specific language (DSL) approach to overcome the difficulties of modeling and simulating morphogenetic processes. A careful discussion of the design goals of a DSL leads to the development of an ex- perimental programming language called MGS. Its declarative approach is based on the notion of topological collection originating from algebraic topology. Topologi- cal collections arise naturally when modeling a "dynamical system with a dynamic structure", or (DS)2, as the state of the system. The evolution function of the system is specified by a transformation, which is a set of rewriting rules where each rule defines a local interaction. We illustrate these notions through different models of the same morphogenetic process: the growth of a T-shaped structure. The objective is to show how a variety of models can be consistently handled within the MGS framework. DOI: 10.1007/978-3-642-33902-8_16 |
| Equipe |
Représentations musicales |
| Cote |
Giavitto13c |
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